基於TMT的蛋白質組學分析

    Tandem mass tags, TMT技術是用Thermo公司開發的串聯質譜標記技術,主要用於鑑定和定量不同樣品中的蛋白質。每種TMT標記試劑由:具有胺反應活性的NHS-酯基團,質量標準化基團和MS/MS報告基團組成。每個標記試劑的同位素標籤具有相同的前體質量,試劑標記酶解後的肽段,可與氨基酸N端及側鏈的伯胺基團發生反應,再透過報告基團進行檢測

    TMT技術最多可採用11種穩定同位素標籤,可同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量,可標記幾乎所有的肽或蛋白質樣品。由於TMT標記技術能夠適用於多達11個樣品的特性,TMT被廣泛應用於定量蛋白質生物標誌物的發現,透過選擇2-plex、6-plex或10-plex同位素的標籤,可同時比較2組、6組或10組不同樣品中蛋白質的相對含量。
    基於TMT的蛋白質組學服務工作流程

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    TMT定量分析透過測定肽片段化過程中以串聯質譜模式(MS2)標記釋放出的片段報告基團離子的強度來進行。在全掃描模式(MS1)下選擇前體離子進行碎片化,因為離子選擇這一步驟可降低噪聲水平,為後續分析步驟提供了有利條件。理想情況下,在前體離子碎片化過程中,僅有一個選定的前體離子發生碎片化。但實際過程中,其他前體離子通常會在指定的m/z視窗中被捕獲,並與選定的前體一起碎裂。

    百泰派克生物科技採用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合nanoLC-MS/MS納升色譜,提供基於TMT的蛋白質組學分析服務。Obitrap Fusion Lumos質譜儀是現在解析度和靈敏度最高的質譜儀,保證了低丰度肽段碎裂片段鑑定的靈敏度;同時在肽段碎裂過程中採取HCD與ETD結合的模式,保證肽段碎裂片段的完整性。

    *TMT蛋白質組學分析技術可用於磷酸化蛋白質組學分析。

    關於樣品
    百泰派克生物科技可對來自液體及固體狀態下的樣品進行TMT蛋白質組學分析。固體樣品,使用冰袋運輸即可;溶液樣品,可進行真空抽乾或冷凍抽乾後,使用冰袋運輸,也可透過乾冰對樣品進行運輸。歡迎來電諮詢。

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