肽段覆蓋率/肽譜圖分析

    蛋白樣品鑑定過程一般只會使用Trypsin對蛋白進行酶切,鑑定到的肽段覆蓋率大概在60%。爲了得到靶蛋白的全部序列資訊,百泰派克公司會選用在蛋白鑑定過程中常用的6種蛋白酶(Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)分別對靶蛋白進行酶切和鑑定,在得到更多的碎裂肽段片段的同時,經過肽段之間的拼接完成蛋白序列100%的測定。百泰派克公司應用現有的質譜技術平臺,提供以LC-MS/MS為基礎的的肽譜圖分析,此分析可以用於確認重組蛋白是否得到完整表達,檢測重組蛋白表達過程是否發生斷裂。主要用於蛋白質一級結構的確認,透過使用多種蛋白質酶切反應和液質聯用技術對肽段的測序,結合專有的分析軟體,能對任何非特異性蛋白酶酶解產物的質譜資料進行分析。從而實現對所測定靶蛋白序列100%的覆蓋。
    20221219-1995-肽段覆盖率.png

    質譜法肽段覆蓋率/肽譜圖全序列測定的流程:

    • 首先使用6種蛋白酶(Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)分別對靶蛋白進行酶切和鑑定
    • 接著使用nano LC-MS/MS或者UV LC-MS/MS對樣品進行分析
    • 將得到的肽段覆蓋率/肽譜圖全序列與您提供的理論序列進行比對
    • 得到比對結果

    質譜法肽段覆蓋率/肽譜圖全序列測定的優點:

    (1)特異性及非特異性蛋白質酶的組合,可實現對任何蛋白質(多肽)的鑑定達到100%的覆蓋率。

    (2)每個肽段的確認包括:1)基於樣品的質量;2)基於樣品的MS/MS指紋圖譜,所以比僅使用一級質譜進行測定更準確。

    樣品要求:

    膠內樣品和溶液樣品均可以用來進行上述測序
    樣品純度越高越好,建議超過80%的蛋白質
    需要的靶蛋白樣品量:10-20ug
    蛋白質膠樣品也可用於肽段覆蓋率測定,但需對樣品進行特殊的前處理。

    案例分析:

    蛋白樣品100%序列驗證服務
    在實際的實驗過程中,按照儘量提高效率和降低花費的原則,我們會首先對客戶提供的理論序列進行分析,分析過程是按照幾種不同的蛋白酶酶切位點進行肽段覆蓋率的預測,假如可以僅僅透過3種蛋白酶酶切就可以100%的覆蓋全序列,實際實驗過程就會先用這3種蛋白酶進行酶切和後續的序列分析實驗,這樣可以有效的降低實驗的成本。以下是之前專案的部分資料,該專案中客戶按照理論序列表達抗體藥物,一級序列需要進行驗證,以證明表達得到的抗體與理論序列一致,部分實驗資料展示如下:
    20221219-2491-肽段覆盖率2.png

    結題報告中,我們會按照下圖所示的方式給出肽段覆蓋率的詳細資料。
    20221219-3038-肽段覆盖率3.png

    中/英文專案報告

    在技術報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:

    1. 實驗步驟(中英文)
    2. 相關的質譜引數(中英文)
    3. 質譜圖片
    4. 原始資料
    5. 生物藥物肽段覆蓋率資訊

    生物藥物肽段覆蓋率測定一站式服務

    您只需下單-寄送樣品
    百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告

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