靶向代謝組學
靶向代謝組學(Targeted Metabolomics)是代謝組學研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對於全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。透過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準確定量定性分析,一方面可以結合其它實驗資料揭示相關的分子生物學作用機制,另一方面,也可以為後續代謝分子標誌物的深入研究和開發利用提供有力支援。靶向代謝組學可以用於:驗證有非靶向代謝組學實驗提出的假說;進行基於假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。
靶向代謝組學分析成功的關鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學鑑定一般採用GC/MS系統的選擇性離子監測 (SIM),或在三重串聯四極杆LC/MS系統上用多反應離子監測 (MRM) 進行靶向MS/MS。SIM比全掃描圖譜採集具有更高的靈敏度,在單四極杆質譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的採集時間。因為監測的是一個很小的質量視窗,所以質量色譜圖只代表對極為特定質量的檢測。在大多數情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM是進行質譜定量的選擇方法,與SIM相比更為靈敏、更加特異。可以產生獨特的碎片離子,可對非常複雜基質中的目標化合物進行監測和定量。
靶向代謝組學的一般分析流程為:
1. 資料採集 第一步是得到標準品。如果無法從市場上買到,就必須定製合成。然後透過最佳化產物離子碰撞能量以得到的訊號,再透過測定三重串聯四極杆測定代謝物的MRM躍遷值。
2. 定量 接下來用定量分析軟體對MRM資料進行處理,得到報告。
3. 統計分析和解釋 將定量報告輸入統計分析軟體包,用統計工具,如ANOVA,對資料進行處理。
靶向代謝組學分析流程
靶向代謝組學研究路線
百泰派克已開發的靶向代謝組學服務
Targeted Metabolomic Pathways | 糖類及糖代謝 | ||
Organic Compounds | Acyl CoAs | 氨基酸及其衍生物 | Animal Hormones |
Aldehydes | Bioamine | Bile Acids | |
Carnitines | Carotenoids | Fatty Acids | |
Flavone | Flax-Liganans | Biomarkers | |
Nucleotides | Oxysterols | Organic Acids | |
Plant Hormone | Resveratrol | Tryptophan Metabolites | |
Thiols | Vitamins & Coenzymes | ||
Inorganic Compounds | Metal/Metallomics | Polyphenols |
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關於樣品
1.微生物和細胞樣本:迅速鈍化代謝活動(淬滅),同時保持細胞不裂解
2.動物體液(如尿、血、組織、器官、唾液):取樣後要迅速預處理,如加入抗凝血劑、防腐劑,並立即冷凍處理(-80℃)
3.植物樣本:採集後迅速冷凍(液氮),然後轉入-80℃儲存,200mg/例。
4.血清樣品:500ul/例(不得低於200ul/例),一定避免反覆凍融。(血液收集在離心管中靜置30分鐘進行凝固。然後離心取上清裝載乾淨的離心管中,再離心5分鐘,8000rpm,取上清分裝到凍存管中,每管0.5ml,-80℃凍存寄送。)
5.尿液樣品:1ml/例,原則上可以多取一點(尿液直接分裝到離心管中,每管1ml,新增一滴(約10ul)質量體積為1/100(w/v)的疊氮化鈉,-80℃凍存寄送)
中/英文資料包告
在最終的技術報告中,百泰派克生物科技會為您提供詳細的中/英文雙語版技術報告,報告包括:
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 代謝分子鑑定結果
靶向代謝組學一站式服務
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