絕對定量分析(AQUA)
AQUA絕對定量分析是一種靶向定量蛋白質組學技術,在各類定量蛋白質組學研究中應用廣泛。絕對定量策略可用於蛋白質及其修飾狀態的絕對定量。將穩定同位素標記的合成肽作為內標,可以模擬蛋白水解形成的天然肽,也可以利用共價修飾(如,磷酸化,甲基化,乙醯化等)來製備。透過在串聯質譜中使用選擇反應監測分析(selected reaction monitoring, SRM),將AQUA內標肽用於蛋白水解後精確定量地測定蛋白質和翻譯後修飾蛋白質的絕對水平。
生物質譜技術的進步促進了大規模量化細胞內蛋白質表達水平分析方法的進步。
絕對定量分析(AQUA)
蛋白質絕對定量策略是蛋白質定量和翻譯後修飾的有效檢測手段。透過使用含有穩定同位素標籤的合成多肽實現絕對定量:透過發現質譜訊號與蛋白質濃度之間的關係為基礎,每摩爾蛋白質中三個最強的胰蛋白酶肽的平均質譜訊號響應是恆定的,變異係數小於10%。只要給定一個內標(含有問答同位素標籤的合成多肽),透過質譜訊號與蛋白質濃度之間的關係可用於測定通用訊號響應因子(counts/mol)。所有測定的蛋白質的通用訊號響應因子都是相同的。
絕對定量方法依賴於使用合成內標肽,該肽在消化過程中以已知濃度引入到細胞裂解液中。在串聯質譜儀檢測過程中,透過SRM法對水解的蛋白樣品進行分析,可以直接檢測和定量天然肽和同位素標記的AQUA內標肽。該方法的簡便、靈敏,加上串聯質譜儀的廣泛應用,使AQUA絕對定量分析策略成為一種直接從細胞裂解物中測定蛋白質水平和翻譯後修飾的有效的方法。
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