真核無參轉錄組測序
真核生物轉錄組測序可以分為有參和無參的情況。其中,無參指在無參考基因組的情況下,對真核生物轉錄組進行測序。真核無參轉錄組測序在獲得原始資料後,首先要進行質控拼接為unigene,再以unigene為參考序列進行後續分析,包括功能註釋、SNP、SSR標記開發等。也可以對多個樣本進行差異基因表達分析和差異基因功能富集分析等,用於發現功能基因,為下一步研究提供方向。
百泰派克生物科技轉錄組測序服務基於Illumina高通量測序平臺,能夠在單核苷酸水平上檢測任何物種的整體轉錄水平。在分析轉錄本的結構和表達水平的同時,還可以發現未知的轉錄本和稀有的轉錄本,並能準確識別可變剪下位點和編碼序列單核苷酸多型性(cSNP),從而提供最全面的轉錄組資訊。
流程明確,減少不必要的樣品和時間浪費,交付時間短;
百泰派克生物科技擁有自主生信分析平臺,除常規分析外,還可提供高階定製分析;
百泰派克蛋白組、代謝組等多組學分析平臺,可進行多組學整合分析,提升文章質量。
RNA樣品(核酸質量≥3 μg,260/280≥2.0,RIN值≥7,28S/18S≥1.0,濃度≥50 ng/μl,體積≥10 μl)。
百泰派克生物科技轉錄組測序服務基於Illumina高通量測序平臺,能夠在單核苷酸水平上檢測任何物種的整體轉錄水平。在分析轉錄本的結構和表達水平的同時,還可以發現未知的轉錄本和稀有的轉錄本,並能準確識別可變剪下位點和編碼序列單核苷酸多型性(cSNP),從而提供最全面的轉錄組資訊。
真核無參轉錄組測序實驗流程
真核無參轉錄組測序實驗流程
服務優勢
經驗豐富的技術人員,可以提供從實驗設計、樣品檢測、資料分析等全套專業服務;流程明確,減少不必要的樣品和時間浪費,交付時間短;
百泰派克生物科技擁有自主生信分析平臺,除常規分析外,還可提供高階定製分析;
百泰派克蛋白組、代謝組等多組學分析平臺,可進行多組學整合分析,提升文章質量。
轉錄組測序樣品要求
細胞(≥5×10^6)、新鮮植物組織(≥500 mg)、動物組織(≥300 mg)、血液(≥2 ml)、FFPE樣品(≥10張未經HE染色處理的切片);RNA樣品(核酸質量≥3 μg,260/280≥2.0,RIN值≥7,28S/18S≥1.0,濃度≥50 ng/μl,體積≥10 μl)。
百泰派克生物科技轉錄組測序案例展示
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