基於SILAC/Dimethyl標記的定量蛋白組分析
SILAC是細胞培養條件下穩定同位素標記技術(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture, SILAC)的簡稱。SILAC實驗流程是:細胞培養基中加入輕、中或重型穩定同位素標記的必需氨基酸賴氨酸(Lys)和精氨酸(Arg),在細胞生長過程中使新合成的蛋白會帶上穩定同位素標籤。等量混合各型別蛋白質,酶解後進行質譜分析。透過比較一級質譜圖中不帶標記/帶同位素標記質譜峰型的面積大小進行相對定量,同時二級譜圖對肽段進行序列測定從而進行蛋白鑑定。與SILAC類似,二甲基Dimethyl標記也是一種同位素蛋白標記的方法。Dimethyl是一種小分子同位素化學標記物,透過化學標記的方法標記細胞裂解後的蛋白或多肽的N端或者賴氨酸的ε氨基基團,使蛋白/多肽標記上不同的Dimethyl標籤。除了標記方法的差別外,SILAC/Dimethyl兩種標記的質譜分析方法基本一致,而且具有相近的分析精度和廣度,在定量蛋白組學分析研究中受到越來越廣泛的運用。
百泰派克公司採用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出基於SILAC/Dimethyl的定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的實驗目的告訴我們並將您的細胞寄給我們,我們會負責專案後續所有事宜,包括細胞培養、細胞標記、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始資料分析、生物資訊學分析。
2.如果您需要自己標記細胞並完成細胞的刺激等處理過程,您只需要將標記完成並且經過處理的細胞樣品或者蛋白樣品乾冰寄給我們即可;對於每個樣品,需要保證含有50-100ug蛋白。
總的來說,SILAC的重複性比Dimethyl稍高一些,因為不同的SILAC樣品在蛋白酶切之前就已經混合在一起,而Dimethyl標記的是酶切後的多肽片段,受到體系穩定性影響更多,因此重複性稍遜於SILAC。但是Dimethyl作為一種優質價廉的標記手段也得到越來越廣泛的應用。
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物資訊學分析
百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
百泰派克公司採用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出基於SILAC/Dimethyl的定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的實驗目的告訴我們並將您的細胞寄給我們,我們會負責專案後續所有事宜,包括細胞培養、細胞標記、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始資料分析、生物資訊學分析。
SILAC定量蛋白組學實驗流程
SILAC定量蛋白組學實驗流程
關於樣品
1.您只需使用乾冰將凍存細胞寄給我們即可,同時保證細胞具有可以傳代培養5次以上的能力;2.如果您需要自己標記細胞並完成細胞的刺激等處理過程,您只需要將標記完成並且經過處理的細胞樣品或者蛋白樣品乾冰寄給我們即可;對於每個樣品,需要保證含有50-100ug蛋白。
Silac與Dimethyl標記法對比
SIALC與Dimethyl標記法對比
SIALC與Dimethyl標記法對比2
總的來說,SILAC的重複性比Dimethyl稍高一些,因為不同的SILAC樣品在蛋白酶切之前就已經混合在一起,而Dimethyl標記的是酶切後的多肽片段,受到體系穩定性影響更多,因此重複性稍遜於SILAC。但是Dimethyl作為一種優質價廉的標記手段也得到越來越廣泛的應用。
中/英文專案報告
在技術報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物資訊學分析
SILAC/Dimethyl定量蛋白組學一站式服務
您只需下單-寄送樣品百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
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