SWATH定量蛋白組學服務
SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold團隊與AB SCIEX共同研發的一項全新的質譜採集模式技術。SWATH作為一種DIA (Data Independent Acquisition)技術,將整個質譜掃描質量範圍分為若干小視窗,依次對每個視窗的所有離子進行碎裂,使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描再進行二級MS/MS分析。因此,SWATH能夠對複雜樣品中幾乎所有可檢測的分子進行定量測定。SWATH綜合了shotgun proteomics高通量檢測的特點與精準定量分析的優勢,是真正意義上的全景質譜檢測手段MS/MS ALL。 百泰派克公司採用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨質譜系統,具有快速掃描速度和串聯四極杆質譜系統的定量靈敏度能力,集質譜系統的高分辨、準確質量數穩定性、高靈敏度和高速度掃描特點於一身,推出SWATH定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的樣品寄給我們,我們會負責專案後續所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始資料分析、生物資訊學分析。
• 定量準確度高:定量準確度與MRM技術相當
• 通量大:一次實驗可定量檢測到2000種以上蛋白
• 完整全面資訊儲存,能夠儲存MS,MS/MS每個峰值的資料,同一樣本無需進行重複檢測
• 無需像MRM技術需要提前除錯樣品測定方法
另外,相比MRM需要根據待檢測的目標分子進行檢測方法最佳化,SWATH無偏差分析所有分子,不需要提前對檢測方法進行最佳化,只需要在已獲得檢測資料的基礎上對分析方法進行最佳化即可。因此,SWATH分析能夠為您極大得縮短檢測分析的週期。
• 多組分樣本PCA分析
• 鑑定的蛋白功能註釋:GO功能註釋、 KEGG功能註釋和COG功能註釋
• 差異表達蛋白統計分析:韋恩圖、火山圖(Volcano Plot)
• 差異表達蛋白聚類分析:層次聚類、K-means聚類
• 差異蛋白相互作用分析:基於STRING資料庫進行蛋白互作網路分析
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物資訊學分析
百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
SWATH定量蛋白組學服務技術平臺
SWATH定量蛋白組學服務技術平臺
SWATH技術特點
• 定量鑑定複雜的樣品中所有分子,包括低丰度蛋白和肽段• 定量準確度高:定量準確度與MRM技術相當
• 通量大:一次實驗可定量檢測到2000種以上蛋白
• 完整全面資訊儲存,能夠儲存MS,MS/MS每個峰值的資料,同一樣本無需進行重複檢測
• 無需像MRM技術需要提前除錯樣品測定方法
SWATH/DIA的優勢介紹
對於複雜樣品定量分析主要的問題往往來自於樣品本身高丰度蛋白的干擾,從而難以鑑定到低丰度蛋白。許多DDA(Data Dependent Acquisition)質譜鑑定方法,都是在MS級別鑑定肽段,優先篩選MS訊號強的肽段進行二級碎裂,因此低丰度的肽段不易被選擇進行二級分析。而SWATH/DIA則是對樣品中的所有分子無差別地進行分析,並一次性將所有肽段的MS,MS/MS資料進行儲存,以保證不遺漏任何可能重要的資料。總的來說,SWATH極大地提高了定量分析的可信度,並能夠高效測定複雜樣品中丰度極低的蛋白分子。DDA與SWATH/DIA質譜分析的對比
另外,相比MRM需要根據待檢測的目標分子進行檢測方法最佳化,SWATH無偏差分析所有分子,不需要提前對檢測方法進行最佳化,只需要在已獲得檢測資料的基礎上對分析方法進行最佳化即可。因此,SWATH分析能夠為您極大得縮短檢測分析的週期。
SWATH定量蛋白組學服務樣品要求
SWATH定量蛋白組學服務樣品要求
生物資訊學分析
• SWATH譜圖分析,蛋白質資料質量評估• 多組分樣本PCA分析
• 鑑定的蛋白功能註釋:GO功能註釋、 KEGG功能註釋和COG功能註釋
• 差異表達蛋白統計分析:韋恩圖、火山圖(Volcano Plot)
• 差異表達蛋白聚類分析:層次聚類、K-means聚類
• 差異蛋白相互作用分析:基於STRING資料庫進行蛋白互作網路分析
中/英文專案報告
在最終的技術報告中,百泰派克生物科技會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物資訊學分析
SWATH定量蛋白組學一站式服務
您只需下單-寄送樣品百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
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