基於Label Free的定量蛋白組分析
蛋白質非標記定量技術(Label Free)是透過液質聯用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析,無需使用昂貴的穩定同位素標籤做內部標準,只需分析大規模鑑定蛋白質時所產生的質譜資料,比較不同樣品中相應肽段的訊號強度,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。
基於SILAC和iTRAQ的定量蛋白組學研究技術都是首先標記蛋白然後利用質譜進行分析;儘管提供的蛋白定量資訊量巨大,但是標記試劑比較昂貴,每一個樣品的成本較大,因此比較適合在整個蛋白組水平上對蛋白的表達變化進行定量的分析;對於相對簡單的蛋白混合物,比如說co-IP的樣品來說,投入產出比比較低;對於某些翻譯後修飾方式的蛋白組學研究來說,比如泛素化研究,本身泛素化就是發生在賴氨酸側鏈上,對於泛素化肽段的富集是利用針對賴氨酸側鏈上殘留的兩個甘氨酸(gly-gly)的抗體來實現的,但是iTRAQ試劑的標記會對此富集過程產生很大的影響,因此就不能使用iTRAQ標記技術對組織樣品的泛素化修飾進行組學水平上的分析。Label Free定量分析技術就是基於此實驗需求建立起來的定量蛋白組學技術。同一個肽段在質譜分析過程中離子化效率相同,質譜峰的面積就直接代表了該肽段量的多少,因此可以直接透過比較同一肽段質譜峰面積的方法直接得到該肽段所代表的蛋白的相對定量資訊。
百泰派克公司採用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出基於Label Free的定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的實驗目的告訴我們並將您的細胞寄給我們,我們會負責專案後續所有事宜,包括細胞培養、細胞標記、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始資料分析、生物資訊學分析。
2. 如果您提供的是組織樣品,請您乾冰將組織樣品寄給我們;動物樣本大於200mg,血液樣品至少1ml(血漿注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,植物樣品至少1g,細胞樣品為1X10^7個細胞,酵母、微生物等乾重200mg。
3. 如果您提供的是蛋白樣品,請您保證蛋白總量在50ug以上;蛋白提取時使用普通的組織、細胞裂解液即可。
4. 樣品運輸:請使用足量的乾冰運輸,並且儘量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物資訊學分析
百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
基於SILAC和iTRAQ的定量蛋白組學研究技術都是首先標記蛋白然後利用質譜進行分析;儘管提供的蛋白定量資訊量巨大,但是標記試劑比較昂貴,每一個樣品的成本較大,因此比較適合在整個蛋白組水平上對蛋白的表達變化進行定量的分析;對於相對簡單的蛋白混合物,比如說co-IP的樣品來說,投入產出比比較低;對於某些翻譯後修飾方式的蛋白組學研究來說,比如泛素化研究,本身泛素化就是發生在賴氨酸側鏈上,對於泛素化肽段的富集是利用針對賴氨酸側鏈上殘留的兩個甘氨酸(gly-gly)的抗體來實現的,但是iTRAQ試劑的標記會對此富集過程產生很大的影響,因此就不能使用iTRAQ標記技術對組織樣品的泛素化修飾進行組學水平上的分析。Label Free定量分析技術就是基於此實驗需求建立起來的定量蛋白組學技術。同一個肽段在質譜分析過程中離子化效率相同,質譜峰的面積就直接代表了該肽段量的多少,因此可以直接透過比較同一肽段質譜峰面積的方法直接得到該肽段所代表的蛋白的相對定量資訊。
百泰派克公司採用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出基於Label Free的定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的實驗目的告訴我們並將您的細胞寄給我們,我們會負責專案後續所有事宜,包括細胞培養、細胞標記、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始資料分析、生物資訊學分析。
Label Free 定量蛋白組學分析流程
Label Free定量蛋白組學服務流程
關於樣品
1. 如果您提供的是co-IP樣品,蛋白需求量在2-5ug左右,在寄送蛋白樣品中不要包含去汙劑(例如SDS)以及高的氧濃度;或者您可以直接將含有蛋白樣品的beads寄給我們,由我們負責後續的實驗。2. 如果您提供的是組織樣品,請您乾冰將組織樣品寄給我們;動物樣本大於200mg,血液樣品至少1ml(血漿注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,植物樣品至少1g,細胞樣品為1X10^7個細胞,酵母、微生物等乾重200mg。
3. 如果您提供的是蛋白樣品,請您保證蛋白總量在50ug以上;蛋白提取時使用普通的組織、細胞裂解液即可。
4. 樣品運輸:請使用足量的乾冰運輸,並且儘量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
中/英文專案報告
在技術報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物資訊學分析
Label Free定量蛋白組學一站式服務
您只需下單-寄送樣品百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
相關服務
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