多肽測序
已經被鑑定識別的天然肽多達數千種,它們在人類的生理過程中扮演著重要的角色,包括作為激素、神經遞質、生長因子、離子通道配體或抗感染等等。多肽類藥物被認為具有高選擇性和有效性,同時,具有相對安全和良好的耐受性。因此,人們對多肽類藥物在藥物研究和開發(R&D)方面的興趣越來越大,數百種多肽類藥物正在進行臨床試驗評估。
肽和蛋白質都是由人體的基本組成部分-氨基酸組成,並透過肽鍵結合在一起。他們的區別在於肽是由比蛋白質小的氨基酸鏈組成的。肽包含兩個或多個氨基酸,可細分為低聚肽和多肽,低聚肽含有少量的氨基酸(約2-20個氨基酸),多肽則含有更多氨基酸。但是這個定義以及科學家使用每個術語的方式有時候並沒有那麼嚴謹。蛋白質是由一個或多個肽連線在一起而形成的。因此,蛋白質本質上是非常大的肽。一般情況下,我們按照氨基酸的數量對多肽和蛋白質進行區分,多肽由2到50個氨基酸組成,而蛋白質則由50個或更多的氨基酸組成。多肽類藥物研究具有巨大的潛力,如新肽的發現,更有針對性的肽庫和序列最佳化設計,新配方的研發,多功能肽及複合物的研發等等。而要實現這些,對多肽進行鑑定,對多肽序列進行分析,是推動研究的第一步。
多肽測序示意圖
基於質譜的多肽序列分析
多肽的序列測定常見的有兩種方法:資料庫搜尋和de novo從頭測序法。比較短的肽段,比如小於30個氨基酸時,百泰派克生物科技採取直接進行二級碎裂的方式得到質譜原始資料進行肽段序列的推導,透過資料庫搜庫或者從頭測序的方式,即可獲得其理論序列。而對於長度比較長的肽段(>30個氨基酸),百泰派克生物科技會使用3種蛋白酶分別對靶肽段進行酶切和鑑定,在得到碎裂肽段片段的同時,經過肽段之間的拼接完成肽段序列100%的測定,即透過從頭測序的方法進行測定。對於部分肽段混合物也可以基於上述方法進行序列分析。
百泰派克生物科技使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀結合Nano-LC納升色譜技術,提供基於質譜的多肽序列分析服務以及多肽de novo從頭測序服務,對多肽序列進行分析。百泰派克使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀實現對肽段樣品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos質譜儀是現在解析度和靈敏度最高的質譜儀,保證了低丰度肽段碎裂片段鑑定的靈敏度;同時在肽段碎裂過程中採取HCD與ETD結合的模式,保證肽段碎裂片段的完整性。得到質譜原始資料之後,對於小於30個氨基酸的肽段我們使用資料庫或de novo從頭測序的方式對原始資料進行解析。>30個氨基酸的肽段一般採用從頭測序的方式對多肽序列進行推導。
樣品製備的建議:
• 儘可能準備100 ug的樣品:<30 aa的樣品至少準備10-25 ug的樣品,>30 aa的樣品儘量準備至少>50 ug且純化的樣品;
• 儘量使用最純的試劑,而不是分子生物學級別的試劑;
• 儘量使用最小的離心管;
• 儘量避免汙染物,或在溶液中對蛋白質進行濃縮。
**可諮詢百泰派克生物科技的技術人員,有針對性的進行樣品製備。
百泰派克生物科技可對來自液體及固體狀態下的樣品進行多肽序列分析。固體樣品,使用冰袋運輸即可;溶液樣品,可進行真空抽乾或冷凍抽乾後,使用冰袋運輸,也可透過乾冰對樣品進行運輸。歡迎來電諮詢。
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