蛋白測序

    蛋白質一級結構是組成蛋白質多肽鏈的線性氨基酸序列。蛋白測序,蛋白序列分析,蛋白一級結構分析,蛋白氨基酸序列分析是確定蛋白質全部氨基酸序列的過程。透過蛋白質測序獲得的資訊,有非常多有價值的用途,包括:1,用於蛋白質的鑑定;2,設計分子克隆的探針;3,合成可用作免疫原的肽段等。

    蛋白測序服務常見有兩種主要的方法:Edman降解(Harvey和Ferrier,2011; Bauer等,1997)和質譜分析(MS)(Sahukar等,2016)。目前使用最廣的蛋白質測序和鑑定方法是質譜法,而Edman降解則是表徵蛋白質N端最重要的方法之一。百泰派克生物科技使用nano LC-MS/MS納升色譜結合串聯質譜島津公司Edman降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基於質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析N端測序C端測序全序列分析,以及基於Edman降解的蛋白質N端序列分析服務。對於未知理論序列的蛋白質,提供基於從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。

    基於質譜的蛋白質序列分析

    質譜法用於蛋白質序列分析,較Edman降解法而言,其優點在於,質譜法更敏感,可以更快地裂解肽,可以識別末端封閉或修飾的蛋白質。百泰派克生物科技利用現有的高解析度質譜技術平臺,提供以質譜為基礎的蛋白質序列分析服務,可實現對所測定靶蛋白序列100%的覆蓋。此分析可以用於確認重組蛋白是否得到完整表達,檢測重組蛋白表達過程是否發生斷裂等。

    蛋白樣品序列分析過程一般只會使用Trypsin對蛋白進行酶切,鑑定到的肽段覆蓋率大概在60%。爲了得到靶蛋白的全部序列資訊,百泰派克生物科技會選用在蛋白序列分析過程中常用的6種蛋白酶(Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)分別對靶蛋白進行酶切和質譜測定,在得到碎裂肽段片段的同時,經過肽段之間的拼接完成蛋白序列100%的測定。百泰派克使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀實現對蛋白樣品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos質譜儀是現在解析度和靈敏度最高的質譜儀,保證了低丰度肽段碎裂片段鑑定的靈敏度;同時在肽段碎裂過程中採取HCD與ETD結合的模式,保證肽段碎裂片段的完整性。可以實現蛋白樣品的N端,C端序列分析以及蛋白全長序列分析。
    蛋白質測序示意圖

    蛋白質測序示意圖


    Edman降解法蛋白質N端序列分析

    Edman降解測序法是能夠獲得蛋白質N端氨基酸序列資訊的化學方法,由Pehr Edman在1950年代初期開發的。該方法可在不干擾肽鍵的情況下標記並對N末端的氨基酸序列進行分析(Hunkapiller,1988; Liu等人,2016)。

    Edman降解法在蛋白質樣品N端序列分析中得到了廣泛應用。但是在實際應用中,Edman降解法也有一定的侷限。例如N末端封閉或有化學修飾的情況下將不能使用Edman降解法對蛋白質序列進行分析。這時就可以藉助先進的nano LC-MS/MS納升色譜結合串聯質譜平臺對N端序列進行質譜測序,質譜平臺可以實現末端封閉和修飾的蛋白質的序列分析,與Edman降解法形成互補,保證N端測序服務的順利進行。百泰派克生物科技採用島津公司Edman測序系統,為廣大科研工作者和科研客戶提供純化後蛋白產物、蛋白疫苗以及各類蛋白樣品的N端測序服務。採用我們的測序系統,可以測定N端多達30個氨基酸的序列資訊。

    樣品製備

    有許多可以進行樣品製備的方法,沒有特定的方法是效果最好的樣品製備方式。每個樣品方式都有各自的優點和缺點。製備特定樣品的最佳方法可結合實驗室的經驗及常用方法,並參考您自己關於產率、純度、成本和速度的要求。最常用於製備蛋白質測序樣品的方法包括:
    1. 十二烷基硫酸鈉-聚丙烯醯胺凝膠電泳(SDS-PAGE)
    2. 高效液相色譜(HPLC)
    3. 毛細管電泳(CE)

    *選擇樣品製備方法時需要考慮的因素包括:1)實驗週期要求;2)樣品的純度要求;3)所需蛋白的質量。如果您暫時不具備樣品製備的條件,百泰派克生物科技一站式蛋白分析服務提供樣品製備服務,歡迎來電諮詢。

    關於樣品

    百泰派克生物科技一站式蛋白測序服務可對來自PVDF膜、膠點、膠條、溶液等狀態下的樣品進行蛋白質序列分析。樣品運輸是大家比較常見的問題,切下的蛋白條帶進行密閉包裝,使用冰袋運輸即可;溶液樣品,可進行真空抽乾或冷凍抽乾後,使用冰袋運輸,也可透過乾冰對樣品進行運輸。歡迎來電諮詢。
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