多肽從頭測序

    多肽的序列分析常見的有兩種方法:資料庫搜尋和de novo從頭測序法。資料庫搜尋需要在已知/給定的資料庫中進行搜庫,從而對多肽序列進行識別。但是由於有些物種的資料庫不足,很多新的或是活性肽無法在資料中匹配到。多肽從頭測序可以解決這個難題。多肽從頭測序是指在沒有序列資料庫的幫助下,利用串聯質譜(MS/MS)獲取肽的氨基酸序列的分析過程。優勢在於,無論有沒有理論資料庫,抑或是新的、未知的多肽均可對其進行序列分析。

    從頭測序的基本原理是利用兩個片段離子之間的質量差來計算肽鏈上氨基酸殘基的質量。多肽從頭測序技術的實現與質譜技術的發展緊密相關。近年來質譜的質量解析度提高了好幾個數量級,尤其是高精確質譜效能的顯著提高為多肽序列分析提供了有力的基礎。
    多肽從頭測序 高質量光譜理論碎片離子示意圖

    多肽從頭測序 高質量光譜理論碎片離子示意圖


    百泰派克生物科技使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀結合Nano-LC納升色譜技術,提供基於質譜的多肽de novo從頭測序服務,對多肽序列進行分析。百泰派克使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀實現對肽段樣品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos質譜儀是現在解析度和靈敏度最高的質譜儀,保證了低丰度肽段碎裂片段鑑定的靈敏度;同時在肽段碎裂過程中採取HCD與ETD結合的模式,保證肽段碎裂片段的完整性。得到質譜原始資料之後,採用從頭測序的方式對多肽序列進行推導。

    樣品製備的建議:
    儘可能準備20 ug以上的樣品,溶液和凍乾粉均可。如果是溶液樣品,buffer中不含有高鹽、SDS等去垢劑。

    **可諮詢百泰派克生物科技的技術人員,有針對性的進行樣品製備。

    百泰派克生物科技可對來自液體及固體狀態下的樣品進行多肽序列分析。固體樣品,使用冰袋運輸即可;溶液樣品,可進行真空抽乾或冷凍抽乾後,使用冰袋運輸,也可透過乾冰對樣品進行運輸。歡迎來電諮詢。
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