泛素化定量蛋白組學研究
BTP-泛素化定量蛋白組學研究
泛素化修飾是一種重要的翻譯後修飾。泛素-蛋白酶體系統介導了真核生物體內80%~85%的蛋白質降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位,調控包括細胞週期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內的多種細胞活動。
百泰派克公司採用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出泛素化定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的實驗目的告訴我們並將您的樣品寄給我們,我們會負責專案後續所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、泛素化肽段富集、肽段分離、質譜分析、質譜原始資料分析、生物資訊學分析。
由於翻譯後修飾的蛋白質在生物樣本中含量低、動態範圍廣,質譜分析前需要對修飾進行富集以提高其丰度,然後利用傳統的定量蛋白組分析手段對富集得到的泛素化肽段樣品進行定量分析。百泰派克公司基於發表在Nature Protocol上的文章:Large-scale identification of ubiquitination sites by mass spectrometry建立了該分析服務的實驗平臺,採用完全複製的方式;首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化,在賴氨酸的修飾位點上會產生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用CST公司提供的針對該殘基的試劑盒對泛素化肽段進行特異性的富集。我們使用HPLC對樣品進行預分離,再使用抗特殊殘基結構的抗體進行泛素化肽段的富集,極大地提高了泛素化蛋白的鑑定量。同時,在Nature Protocl文章基礎上,爲了鑑定和定量更多的乙醯化肽段,我們在酶切過程中會使用2-3中不同的酶對蛋白樣品進行酶切,保證帶有乙醯化位點的肽段以高離子化效率的方式進入質譜進行分析,排除因為肽段長度不合適、離子化效率低造成的乙醯化資訊的丟失。
泛素化修飾研究路線
BTP-泛素化定量蛋白組學研究分析樣品要求
1. 如果您提供的是組織樣品,請您乾冰將組織樣品寄給我們;植物組織樣本大於400mg,血液樣品至少2ml(血漿注意用EDTA防凝),血清2ml,尿液10ml,動物組織樣品至少2g,細胞樣品為1X10^8個細胞,酵母、微生物等乾重400mg。
2. 如果您提供的是蛋白樣品,請您保證蛋白總量在2-5mg;蛋白提取時使用普通的組織、細胞裂解液即可。
3. 樣品運輸:請使用足量的乾冰運輸,並且儘量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
4. 在正式實驗之前,我們都會對您提供的樣品進行檢測,檢測合格後開始正式試驗。
BTP-泛素化定量蛋白組學研究案例
泛素化修飾研究案例
中/英文專案報告
在技術報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 鑑定的泛素化位點的詳細資訊
4. 質譜圖片
5. 原始資料
BTP-泛素化定量蛋白組學一站式服務
您只需下單-寄送樣品 百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
相關服務
翻譯後修飾蛋白組分析
組蛋白翻譯後修飾分析
4D蛋白質組學
DIA定量蛋白質組學
基於Label Free的定量蛋白組分析
基於標籤的蛋白質定量技術-iTRAQ,TMT,SILAC
MRM/PRM定量蛋白組學分析
How to order?