多組學分析FAQ彙總

  • • 轉錄組測序數據處理求助:gene id如何轉換成gene symbol?

    將轉錄組測序數據中的基因ID(例如ENSEMBL ID、RefSeq ID等)轉換爲基因符號(Gene Symbol)是生物信息學分析中常見的需求。以下是一些常用的方法和工具: 1.使用生物信息學工具包:可以使用一些生物信息學工具包進行轉換,例如Bioconductor

  • • 各位老師,請問宏轉錄組測序和轉錄組測序有什麼區別?

    "宏轉錄組測序"和"轉錄組測序"這兩個術語在科學文獻中並未明確區分。然而,從名稱來看,可以做出一些合理的推斷。 "轉錄組測序"是用於測定特定時間點、特定條件下,生物體內所有RNA的序列和相對數量。這些信息可以幫助研究人員理解基因在何時何地以及如何被轉錄。 "宏轉錄

  • • 如何完成RNA-seq的分析流程?

    RNA-seq(RNA測序)是一種使用高通量測序技術來研究整個細胞轉錄組(包括mRNA,ncRNA等)的方法。它可以用來研究在特定時間點和/或條件下,哪些基因被表達以及表達的程度。 以下是一個常規的RNA-seq分析的基本步驟,這個流程可能會根據具體的實驗設計和分析目標

  • • RNA 測序技術的應用場景有什麼?

    RNA測序(RNA-seq)是一種應用廣泛的技術,可以用於許多生物學和醫學研究的領域。以下是一些常見的RNA-seq的應用場景: 1.基因表達分析:RNA-seq可以用於測量不同樣本或條件下基因的表達量,從而可以研究基因的表達調控機制,或者找出在特定條件下表達量變化的基

  • • 請教RNA-seq數據標準化問題?

    RNA-seq數據標準化是在數據分析過程中的一個重要步驟,目的是消除測序深度、基因長度、樣本間差異等因素對數據的影響,以便更準確地比較不同樣本的基因表達水平。 以下是幾種常見的RNA-seq數據標準化方法: 1.RPKM/FPKM(Reads/Fragments

  • • 轉錄組測序,表達量可以平均嗎?

    轉錄組測序的表達量可以在一定程度上進行平均,但這需要考慮實驗設計和目的。在某些情況下,對轉錄組表達量進行平均可能有助於消除個體差異、實驗噪音以及生物學上的變異。然而,在其他情況下,平均表達量可能會掩蓋一些重要的差異或模式。 對轉錄組測序的表達量進行平均時,需要考慮以下幾

  • • 轉錄組測序後可以做什麼實驗?

    轉錄組測序(RNA-seq)是一種強大的研究基因表達的技術。這項技術產生的數據可以進一步用於多種分析和實驗設計,比如: 1.差異基因表達分析:這是最常見的分析類型。研究者比較不同條件或處理下(例如,疾病和正常,或者處理和對照)的轉錄組,以找出那些在不同條件下表達差異顯著

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