多組學分析FAQ彙總
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在轉錄組測序(如RNA-seq)中,如果觀察到AT分離現象,即高比例的腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)而低比例的鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C),可能是由多種原因引起的: 1. GC含量偏低: GC含量是指DNA或RNA序列中G和C的比例。在轉錄組測序中,如果待測樣品的GC含量較低,那麼在測序過程中
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當進行轉錄組測序後,我們通常會得到大量的轉錄組數據。爲了從這些數據中篩選出有意義的信息,我們可以採取以下步驟進行後續篩選: 1. 數據質控: 首先,我們需要對測序數據進行質控,以確保數據的準確性和可靠性。包括檢查測序質量得分、去除低質量的鹼基、去除接頭序列和過濾掉含有未知鹼基的reads等
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• 想送肺炎支原體患兒肺泡灌洗液的轉錄組學,但pbs長菌了,對樣本結果有影響嗎?
當我們討論實驗樣本的準確性和可靠性時,任何的污染都是不可接受的。在你提到的情況下,肺泡灌洗液的樣本中PBS(磷酸鹽緩衝溶液)的細菌污染可能會對轉錄組學分析的結果產生顯著影響: 1.基因表達的干擾: 細菌的RNA可能會與患兒的RNA混合,導致在後續的RNA測序中,我們無法區分哪些RNA來自患
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• 送幾株細胞去轉錄組測序,細胞間基因表達量相差好大,該如何處理?
當細胞轉錄組測序結果顯示顯著的基因表達差異時,可以通過數據標準化、批次效應校正、考慮細胞週期的影響、數據篩選、深入的生物統計分析以及考慮生物學因素等方法進行處理。
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對於RNA病毒擴增子測序,引物設計是關鍵的一步。通常需要根據病毒基因組的特點和目標區域來設計引物。希望以下引物設計的一般步驟可以幫助到您: 1.選擇目標區域:首先需要確定要進行擴增子測序的病毒基因組中的目標區域。選擇目標區域時應考慮具有較高保守性、生物學功能重要性和/或與病原性相關的
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多組學具有以下優勢: 它允許研究人員直接測量生物表型的原因和結果,而不是根據不完整的數據進行推斷。 它幫助研究人員更好地將基因型與表型聯繫起來,提供僅靠單一組學方法無法獲得的科學見解,並有助於推動新藥物靶標的發現。 它通過允許研究人員見證生命分子之間複雜的相互作用,增加了發現能力並提供了對生
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基因組學+轉錄組學 結合 RNA-Seq 可以幫助研究人員對變異進行註釋和優先排序,以進行功能分析,瞭解疾病機制。功能基因組學的多組學方法可以幫助推動藥物靶標識別和生物標誌物發現。 基因組學+表觀遺傳學 全面的表觀遺傳分析可以揭示基因調控模式,以幫助發現 GWAS 識別的變體的功能。將甲基
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RNA-Seq是一種利用下一代測序技術進行轉錄組分析的方法。RNA-Seq提供了每個樣品中RNA序列的全面、定量和無偏倚的視圖,是目前可用於分析基因表達的最強大的工具。相關服務:多組學整合分析
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我們建議從總RNA開始。但是,我們在從各種材料(包括細胞團塊、新鮮冷凍組織、血液和FFPE載玻片)中提取RNA方面擁有豐富的經驗。我們還接受用於超低輸入RNA-Seq的分選細胞。相關服務:多組學整合分析
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由於核糖體RNA(rRNA)佔總RNA的大部分,因此去除它對於其他RNA種類(如mRNA、長鏈非編碼RNA(lncRNA)和小RNA)的高效測序是必要的。 對於標準和鏈特異性RNA-Seq,您可以選擇poly-A選擇或rRNA耗盡方法。Poly-A選擇對於真核生物中mRNA的研究是足夠的。分
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