代謝組學FAQ彙總

• • 一般什麼代謝途徑會產生內源性化合物？

  內源性化合物主要是通過體內的代謝過程產生的，包括但不限於碳水化合物、脂類、蛋白質和核酸。這些過程可以概括爲以下幾個關鍵途徑： 1.糖酵解途徑： 這是在細胞質中進行的一系列反應，將葡萄糖轉化爲丙酮酸，併產生ATP和NADH。在這個過程中，可以產生多種內源性化合物，如丙酮酸和乳酸。 2.三羧

• • 二元邏輯迴歸分析研究代謝物和疾病狀態間的關係，數據異常值和缺失值佔數據百分之多少算數據質量合格？數據清洗最多剔除多少比例異常值？

  1.數據質量合格的判定 在進行二元邏輯迴歸分析研究代謝物與疾病狀態之間的關係時，關於數據異常值和缺失值的處理沒有固定的標準或百分比規定，因爲數據中異常值和缺失值的“合格”比例取決於多種因素，包括研究的具體領域、數據的性質以及數據量的大小。但是，如果數據集中的異常值或缺

• • 鹼式提取阿拉伯木聚糖的具體步驟可以發一下嗎？

  1.原料準備： 選擇合適的阿拉伯木含量高的原料，如豆科植物種子。 2.粉碎和篩分： 將原料粉碎至適宜的粒度，並通過篩分去除大顆粒。 3.預處理： 使用乙醇或其他有機溶劑去除原料中的脂類和其他可溶性雜質。 4.鹼處理： 將處理後的原料與一定濃度的鹼性溶液（通常是氫氧化鈉或氫氧化鉀）混合。

• • 外泌體的質譜和外泌體的脂質組學中是不是有重疊的地方

  外泌體質譜和外泌體脂質組學確實存在一定程度的重疊，但它們側重於分析不同類型的分子。 一、外泌體質譜 1.側重點： 質譜技術在外泌體研究中通常用於鑑定和量化蛋白質。這種方法能夠提供關於外泌體中蛋白質組成的詳細信息。 2.應用： 通過質譜分析，研究人員可以識別外泌體中的特定蛋白質，這些蛋白

• • 線性迴歸做代謝物和疾病狀態之間的關係有沒有具體的操作步驟，我查到的是疾病和代謝物濃度只能做二元邏輯迴歸，做不了線性迴歸

  線性迴歸可以用來研究代謝物和疾病狀態之間的關係，但它是否適用取決於數據的性質和研究的具體目標。 1.疾病狀態爲二元分類變量（如有病/無病）： 在這種情況下，邏輯迴歸是更合適的選擇。邏輯迴歸適用於因變量是分類的情況，特別是在處理二元分類（如是/否，有病/無病）時。這種方法可以幫助你評估代謝物

• • 用凝膠層析分析純化阿拉伯木聚糖的具體方法過程，詳細點

  凝膠層析是一種常用於分離和純化高分子量生物大分子（如多糖、蛋白質等）的技術。下面是利用凝膠層析分析純化阿拉伯木聚糖的具體步驟： 一、準備阿拉伯木聚糖樣品 1. 將含有阿拉伯木聚糖的樣品溶解在適當的緩衝溶液中，確保完全溶解. 2. 通過離心或過濾等方法去除溶液中的不溶雜質。 二、選擇合

• • 做臨牀代謝組學，疾病組和對照組OPLSDA分不開，但P值和FC值都顯示存在差異，請問怎麼解決？可以採用線性迴歸做組間差異嗎

  在臨牀代謝組學研究中使用正交偏最小二乘判別分析（OPLS-DA）對疾病組和對照組進行分析，如果發現這兩組無法明顯區分，但P值和摺疊變化（Fold Change, FC）值顯示存在差異，這可能是由多種因素引起的。這裏有幾個建議和解決辦法： 1. 重新評估OPLS-DA模型 模型參數調整：調

• • 一個樣本的脂質組學結果和這個樣本的質譜有什麼區別嗎，是不是質譜結果裏包含着脂質組學

  脂質組學結果通常是基於質譜技術獲得的。質譜（Mass Spectrometry, MS）是一種強大的分析技術，可用於檢測和量化樣本中的分子，包括脂質。在脂質組學研究中，質譜是主要的分析工具，用於鑑定和量化樣本中的脂質分子。 質譜與脂質組學的關係 1.脂質組學： 脂質組學是生物學的一個分支

• • 菌液上清代謝組學前處理需要LCMS嗎？懷疑是培養基裏的鹽分和糖分影響峯型，如果要除鹽除糖需要什麼類型的柱子呢？

  液相色譜-質譜（LC-MS）不屬於前處理分析了，而是一種分析技術，主要用於分析和鑑定複雜生物樣品中的代謝物。如果您懷疑培養基中的鹽分和糖分影響了峯型，可以使用以下類型的色譜柱： 1.凝膠過濾色譜柱（Gel Filtration Chromatography）： 使用具有特定孔徑的柱子，如S

• • 阿拉伯木聚糖的純化過程可以發一下嗎

  阿拉伯木聚糖的純化過程通常包括以下幾個步驟： 1.去除雜質： 首先，使用離心或過濾的方法去除提取液中的懸浮顆粒和其他大分子雜質。 2.透析： 將提取液置於透析袋中，用於去除小分子雜質。透析袋的孔徑應該小於阿拉伯木聚糖的分子大小，以保證阿拉伯木聚糖留在袋內，而鹽分和其他小分子雜質可以透過袋