肽質量指紋圖譜分析
肽質量指紋圖譜(PMF),也稱為蛋白質指紋,是一種開發於1933年的蛋白質高通量分析方法,用於鑑定蛋白質。內切蛋白酶首先將未知的靶蛋白裂解為較小的肽段,這些肽的絕對質量可以使用質譜儀進行準確測量,並且還可以獲得未知蛋白質的肽峰列表。使用生物資訊學方法將峰列表與蛋白質資料庫中的理論肽峰列表進行比較。理論資料庫將所有有機體的所有已知基因組翻譯成蛋白質,理論上將蛋白質水解成小肽,並將每種蛋白質計算出肽的絕對質量。同時,還將裂解的未知蛋白質的肽質量與基因組中編碼的每種蛋白質的理論肽質量進行比較,對結果進行統計分析可以找到最佳匹配。
生物組織或細胞中的蛋白質純化後,用2D或SDS-PAGE凝膠分離並使用成像技術進行比較。選擇差異顯著的蛋白進行進一步分析。對選定的蛋白質進行脫膠和酶解,得到一系列能反映蛋白質特性的肽段。透過質譜精確測量肽混合物的指紋圖譜,從而獲得蛋白質的分子量。為在已知資料庫中搜索所選蛋白質提供了準確性。
2.過程簡單快速,是一種使用一級質譜法進行蛋白質鑑定的經典方法。
2.適用於單一蛋白質分析。混合蛋白質的存在會大大增加分析的複雜性;
3.質量相似的肽會大大增加匹配的難度。
MALDI使用鐳射照射由樣品和基板形成的共晶薄膜。基質從鐳射吸收能量並將其轉移到生物分子上。在電離過程中,質子被轉移到生物分子或從生物分子中獲得,生物分子發生電離。因此,MALDI是一種軟電離技術,適用於混合物和生物大分子的測定。TOF的原理是,在電場的作用下,離子加速透過飛行管飛行,並且根據飛行到檢測器的時間來檢測離子。MALDI-TOF-MS具有高靈敏度、高精度和高解析度的特點。它在生命科學和許多其他領域中的樣本分析起重要作用。
百泰派克生物科技提供基於肽指紋圖譜PMF的蛋白質組質譜鑑定服務,歡迎諮詢。
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白質分子量和純度分析結果
百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告
肽質量指紋圖譜分析過程
肽質量指紋圖譜分析過程
生物組織或細胞中的蛋白質純化後,用2D或SDS-PAGE凝膠分離並使用成像技術進行比較。選擇差異顯著的蛋白進行進一步分析。對選定的蛋白質進行脫膠和酶解,得到一系列能反映蛋白質特性的肽段。透過質譜精確測量肽混合物的指紋圖譜,從而獲得蛋白質的分子量。為在已知資料庫中搜索所選蛋白質提供了準確性。
肽質譜指紋圖譜的應用
隨著分析化學技術的發展,PMF因其靈敏度高、穩定性好、樣品損失小而被廣泛應用於藥品真實性鑑定、食品質量控制、人類疾病診斷等各個領域。世界衛生組織和中國國家食品藥品監督管理局將PMF作為一種物質鑑別和過程控制技術,為質量評價提供客觀指標。肽質譜指紋圖譜的優點
1.不需要依靠蛋白質測序來進行蛋白質鑑定,而是依靠肽的質量;2.過程簡單快速,是一種使用一級質譜法進行蛋白質鑑定的經典方法。
肽質譜指紋圖譜的限制
1.目的蛋白質序列必須存在於目標資料庫中;2.適用於單一蛋白質分析。混合蛋白質的存在會大大增加分析的複雜性;
3.質量相似的肽會大大增加匹配的難度。
MALDI-TOF肽質量指紋圖譜
快速準確地鑑定蛋白質在蛋白質組學研究中至關重要。PMF可以透過基質輔助鐳射解吸電離離子源(MALDI)和飛行時間(TOF)質量分析儀進行測量。它是蛋白質組學研究中最常用的方法之一。MALDI使用鐳射照射由樣品和基板形成的共晶薄膜。基質從鐳射吸收能量並將其轉移到生物分子上。在電離過程中,質子被轉移到生物分子或從生物分子中獲得,生物分子發生電離。因此,MALDI是一種軟電離技術,適用於混合物和生物大分子的測定。TOF的原理是,在電場的作用下,離子加速透過飛行管飛行,並且根據飛行到檢測器的時間來檢測離子。MALDI-TOF-MS具有高靈敏度、高精度和高解析度的特點。它在生命科學和許多其他領域中的樣本分析起重要作用。
百泰派克生物科技提供基於肽指紋圖譜PMF的蛋白質組質譜鑑定服務,歡迎諮詢。
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2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 蛋白質分子量和純度分析結果
肽質量指紋圖譜分析一站式服務
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