單細胞分析FAQ彙總

• • ScATAC-Seq如何進行質控？

  一站式scATAC-Seq服務通常包含三個QC步驟：1、生成scATAC-Seq文庫後，使用TapeStation或等效工具評估每個文庫的質量和片段大小，並使用qPCR確認總量。2、淺測序（讀取5-10M reads）並進行分析以評估質量指標（FRIP和峯數），然後再進行深度測序。3、全面測

• • ScATAC-Seq是否專門針對人類樣本？

  scATAC-Seq與人類和小鼠樣品均兼容。相關服務:單細胞測序

• • ScATAC-Seq與FFPE/降解樣品兼容嗎？

  不兼容。因爲福爾馬林固定過程會導致DNA降解，這會對染色質結構造成不利影響，從而對數據產生負面影響。相關服務:單細胞測序

• • ScRNA-Seq有哪些優勢？

  scRNA-Seq可用於識別複雜樣本中具有不同轉錄組特徵的細胞亞羣，無需使用FACS或磁性分選等分離策略，不會因樣本操作而改變樣本的生物學特性。相關服務:單細胞測序

• • 單細胞轉錄組測序與批量轉錄組測序有何不同？

  批量轉錄組測序可以評估由於實驗條件引起的表達變化（它不是單個細胞類型特有的），單細胞轉錄組測序能夠評估細胞類型之間的差異或發現細胞類型。單細胞轉錄組測序數據比批量轉錄組測序大得多。相關服務:單細胞測序

• • 什麼是單細胞多組（Single-Cell Multiome ）？

  單細胞多組即scRNA結合scATAC，其可以測量基因表達並繪製來自同一細胞的開放染色質。相關服務:單細胞測序

• • 單細胞多組學只針對人類樣品嗎？

  Single-Cell Multiome 與人類和小鼠樣本兼容。 其他物種在生物信息學上不受支持（Cell Ranger 軟件僅限於人類和小鼠）。​相關服務:單細胞測序

• • 單細胞多組學分析需要多少樣品細胞？

  冷凍保存的細胞：25-200萬個；或冷凍組織20-50mg。相關服務:單細胞測序

• • Single-Cell Multiome與FFPE/降解樣品兼容嗎？

  不兼容。因爲福爾馬林固定過程會導致DNA降解，這會對染色質結構造成不利影響，從而對數據產生負面影響。相關服務:單細胞測序

• • 死細胞如何影響ScATAC測序數據？

  細胞活力低會導致Chromium控制器中的細胞恢復不可靠，進而導致測序目標缺失和結果欠佳。此外，死亡或凋亡細胞釋放的環境DNA片段會增加背景噪音，從而影響數據質量。爲了最大限度地提高單細胞項目中有用的測序數據量，必須儘量減少死細胞的存在。我們建議細胞活力超過90%，最低爲70%。存活率低於7