未知代謝物鑑定中,代謝組學下機數據怎樣對聚合物進行註釋呢?
下機資料的註釋過程大致可以分為以下幾個步驟:
1.資料預處理:
首先需要對下機資料進行質量控制、峰值檢測和峰值對齊等預處理步驟,以便提取有用的訊號並減少背景噪聲。
2.特徵檢測:
透過軟體工具識別出代謝特徵,即在質譜圖中檢測到的獨立的質荷比(m/z)和保留時間(RT)對。
3.質譜資料庫匹配:
透過將檢測到的離子峰與質譜資料庫(如METLIN、MassBank等)中的已知聚合物譜圖進行匹配,以實現初步註釋。這一步驟通常需要考慮質量誤差和碎片模式。對於聚合物,這個步驟可能需要依賴於特定的質譜碎片圖譜和可能的串聯質譜(MS/MS)資料來輔助確定聚合物的結構。
一旦鑑定出特定的聚合物,可以進一步利用代謝途徑資料庫(如KEGG、Reactome等)來探索這些聚合物在生物代謝途徑中的作用和相互作用。
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