蛋白質組學數據質量評估

蛋白質組學質譜資料是蛋白質組學分析的根本，質譜圖譜的質量與檢索分析結果的精準密切相關，因此，對於蛋白質組學資料的質量評估尤為重要。爲了保證生物資訊分析的可靠性，百泰派克從以下4個方面對鑑定到的蛋白組資料進行質量評估：

1. 肽段匹配誤差分佈
2. 肽段數量分佈
3. 肽段長度分佈
4. 蛋白質分子質量分佈

1. 肽段匹配誤差分佈分析

所有匹配到的肽段的相對分子量的真實值和理論值之間的誤差分佈如下圖所示：




圖1 肽段匹配誤差分佈圖


2. 肽段數量分佈分析

鑑定到的蛋白所含肽段數量分佈情況如下圖所示：




圖2 肽段數量分佈圖

注：橫座標為肽段的數量範圍，縱座標為蛋白數量。

3. 鑑定肽段長度分佈分析

鑑定到的肽段長度分佈圖如下：




圖3 肽段長度分佈圖

注：橫座標為肽段的長度分佈，縱座標為肽段數量。

4. 蛋白質分子質量分佈分析





圖4 蛋白質分子質量分佈圖

注：橫座標為蛋白的分子質量範圍，縱座標為蛋白數量。