高通量基因敲除後蛋白組學分析

蛋白質組學是一門研究生物體內所有蛋白質的組成、結構、功能以及相互作用的科學領域，它的目標是建立全面的蛋白質清單，並理解它們在生命過程中的作用。但是，目前被充分研究了生物學功能的蛋白質仍然較少，一些蛋白質編碼基因仍然沒有相關的註釋，非同義單核苷酸多型性以及選擇性剪接和翻譯後修飾過程產生的大量蛋白質型別也使這一研究變得更為困難。高通量基因敲除技術的出現為大規模蛋白質和蛋白質形態檢測提供了強有力的工具。高通量基因敲除技術可以用來沉默或敲除特定基因，進而觀察蛋白質組中的變化，結合高解析度質譜技術，可以用來分析蛋白質的組成、修飾和相對丰度。

Dolgalev G,et al. Genes. 2021.

高通量基因敲除技術在蛋白質組學中的應用

高通量基因敲除技術和蛋白質組學的結合爲生物學研究提供了全新的視角。透過結合這兩種技術，研究人員可以研究特定基因敲除對蛋白質組的影響，識別與被敲除基因相關的蛋白質，從而更好地理解基因與蛋白質之間的相互作用，揭示蛋白質調控網路。例如，研究人員可以確定特定基因的敲除如何影響癌細胞中的蛋白質表達，從而尋找新的癌症治療方法。此外，這種結合還可以用於研究神經退行性疾病、免疫疾病和代謝紊亂等多種疾病的機制。

百泰派克生物科技（BTP）基於高解析度蛋白質組學分析平臺，結合高通量基因敲除技術，可以為您提供從基因敲除到蛋白質組分析的整體方案。我們最佳化的CRISPR/Cas9系統可實現人/小鼠細胞系、原代細胞、免疫細胞及iPS細胞的單/多基因敲除、移碼突變和大序列敲除。獲得KO細胞後對其進行培養並提取KO細胞表達的蛋白質，利用高分辨質譜平臺進行蛋白組分析，透過對蛋白質組成及水平的鑑定解釋特定敲除基因在蛋白質水平上的作用，揭示基因調控蛋白質的機制。BTP自建7大檢測平臺，擁有CNAS/ISO9001雙重質量體系認證實驗室，旨在為您提供最優質的科研服務，我們期待與您的合作，歡迎免費聯絡我們，瞭解更多服務詳情！

服務優勢

1）敲除效率保證：最佳化的CRISPR/Cas9系統，超過80%靶點敲除效率在70%；基因敲除後，我們採用Sanger測序和深度蛋白質組學技術對敲除效率進行雙驗證，雙重保障資料的真實性。

2）完善的蛋白質組學分析平臺：我們的蛋白質組學分析平臺配備完善的樣品前處理儀器、高特異性蛋白修飾富集平臺、超高效液相色譜高分辨質譜聯用以及蛋白N端序列分析儀，可實現組學水平上蛋白質的高效提取、特定修飾肽段的高效富集以及蛋白的鑑定、相對定量（3D & 4D）和絕對定量分析，能對KO細胞表達的蛋白質組進行全面的分析。

3）專案週期短：在進行基因敲除實驗前，我們會對不同細胞中基因必要性及表達量進行分析，確保實驗的可行性，降低實驗失敗風險；且無需針對客戶的靶點設計預實驗進行gRNA驗證，大大縮短了專案週期。

4）一站式服務：BTP擁有豐富的組學服務經驗以及專業的技術人員，可以根據您的需求定製最優的專案方案，您只需將您的實驗目的告訴我們並寄送樣品，BTP負責所有專案後續，包括樣品處理、實驗分析、資料分析和專案報告。

應用領域

1.疾病機理研究

透過敲除特定基因，研究人員可以觀察疾病狀態下的蛋白質表達和調控變化。例如，在癌症研究中，透過敲除與癌症發展相關的基因，可以更好地理解腫瘤的生物學機制。

2.藥物靶標發現

透過分析基因敲除對蛋白質組的影響識別新的藥物靶標。例如，在尋找治療阿爾茨海默病的新藥物時，研究人員可以透過敲除與認知功能下降相關的基因來尋找潛在的治療靶點。

3.功能基因組學研究

結合基因敲除技術和蛋白質組學研究基因和蛋白質在細胞中的功能，以及它們如何相互作用來調控生物過程。

4.系統生物學

在系統生物學領域，結合基因敲除技術和蛋白質組學建立蛋白質-蛋白質相互作用網路，幫助理解複雜的生物系統。例如，研究人員透過分析特定病理條件下的蛋白質組變化揭示疾病過程中的關鍵調控網路。

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