dda屬於非標記定量蛋白質組學嗎
DDA(Data-Dependent Acquisition)屬於非標記定量蛋白質組學的方法之一。在蛋白質組學研究中,定量方法大致分為兩類:標記定量和非標記定量。DDA是一種常用的非標記定量方法,它依賴於質譜儀的資料依賴模式來選擇特定的前體離子進行進一步的碎片分析。這種方法不需要事先對蛋白質或肽段進行化學標記,從而簡化了樣本處理過程。DDA在蛋白質組學中廣泛應用,尤其是在複雜樣本的蛋白質鑑定和定量分析中。
圖1. DIA定量蛋白質組學
DDA(Data-Dependent Acquisition)技術的關鍵點如下:
1、質譜分析基礎:
DDA是基於質譜技術的非標記定量蛋白質組學方法。它透過分析肽或蛋白質的質量和碎片圖譜來鑑定蛋白質。
2、自動選擇前體離子:
在MS(質譜)掃描過程中,DDA自動選擇一定數量的最強訊號的肽離子(前體離子)進行MS/MS(串聯質譜)掃描。
3、碎片化分析:
所選肽離子在MS/MS掃描中被碎片化,產生特定的碎片圖譜。這些圖譜對於鑑定特定的蛋白質序列至關重要。
4、應用範圍:
DDA適用於複雜樣本的蛋白質鑑定和定量分析,尤其在蛋白質組學研究中應用廣泛。
5、優勢:
操作簡便,適用於廣泛的樣本型別,能有效鑑定和定量多種蛋白質。
6、侷限性:
對低丰度蛋白的檢測敏感度較低,結果的重複性受樣品複雜度和質譜儀效能的影響。
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