抗體從頭測序:揭示抗體氨基酸序列的關鍵技術
抗體從頭測序是指在事先不知道DNA或蛋白質序列的情況下推導抗體的氨基酸序列並發現任何相關的翻譯後修飾的分析過程。
抗體序列資訊對於理解抗原結合的結構基礎至關重要,並使抗體能夠用作治療和研究工具。單克隆抗體的測序有助於生物製藥和診斷試劑盒的開發。特別是一抗序列分析是抗體開發和人源化抗體藥物開發的基礎。然而,由於抗體產品的變異和修飾,大多數抗體的序列資訊往往不包含在可用的資料庫中。從頭測序技術採用先進的數據處理演算法進行序列分析,與依賴資料庫的傳統方法相比具有優越的優勢。使用從頭測序方法可以準確地分析抗體測序,無需資料庫搜尋。
圖1.單克隆抗體的從頭測序示意圖
在典型的抗體從頭測序工作流程中,通常使用一組不同的酶(一次一種或幾種的組合)消化抗體,包括最常用的酶:胰蛋白酶和其他幾種酶,例如 Glu-C、Asp-N、如果需要,可以在酶消化之前分離抗體的重鏈和輕鏈。然後透過 LC-MS/MS 分析消化的肽。最後使用最先進的計算演算法進行資料分析,有效推導消化肽的氨基酸序列並組裝重疊肽。
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