ATAC-seq測序原理(染色質可及性)
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一種用於研究染色質開放區域(即易於轉錄因子和其他蛋白質結合的DNA區域)的技術。ATAC-seq利用一個被稱為Tn5轉座酶的蛋白質將測序接頭插入到活躍的染色質區域,轉座酶的作用導致DNA斷裂,產生長度不等的DNA片段。這些片段反映了染色質的開放狀態,因為緊密包裹的DNA區域對轉座酶不可及。插入測序接頭的DNA片段隨後透過PCR方法擴增,然後進行高通量測序。測序得到的資料經過分析,可以揭示哪些染色質區域在特定條件下是開放的。ATAC-seq的優勢在於它能夠快速、靈敏地檢測整個基因組範圍內的染色質開放狀態,對於理解基因表達調控和細胞型別特異性的表觀遺傳學特徵非常有用。
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