代謝組學-生信繪圖,這是用什麼軟件做的呢?

    生信繪圖是代謝組學研究中的一個重要環節,它可以幫助研究人員視覺化和解釋代謝組學資料,從而更好地理解代謝網路和代謝通路的調控。有多種軟體可以用來進行資料視覺化和繪圖:


    1.R語言:

    R是一種統計分析和繪圖的程式語言,它有豐富的生物資訊學和生物統計學的相關包,如ggplot2、pheatmap、heatmap.2等。這些包可以用來繪製熱圖、散點圖、折線圖等,用於展示代謝組學資料的差異和趨勢。


    2.MetaboAnalyst:

    MetaboAnalyst是一個線上代謝組學分析平臺,它提供了豐富的分析工具和繪圖功能。使用者可以上傳代謝組學資料,進行資料預處理、差異分析、通路分析等,並生成各種圖表,如熱圖、箱線圖、散點圖等。


    3.Cytoscape:

    Cytoscape是一個開源的網路分析和視覺化平臺,它可以用來繪製代謝網路圖。使用者可以將代謝組學資料中的代謝物和代謝通路資訊匯入Cytoscape,然後根據代謝物之間的相互作用關係進行網路佈局和視覺化。


    4.PathVisio:

    PathVisio是一個專門用於繪製生物通路圖的軟體,它支援多種生物通路資料庫的匯入和視覺化。使用者可以將代謝組學資料中的代謝物與生物通路資訊關聯起來,然後使用PathVisio繪製代謝通路圖,展示代謝物在通路中的位置和調控關係。


    根據具體的研究目的和資料型別,研究人員可以選擇適合自己的軟體進行資料分析和視覺化。同時,還可以結合多個軟體的功能,進行更全面和深入的分析。


    百泰派克生物科技--生物製品表徵,多組學生物質譜檢測優質服務商


    相關服務:

    PLS-DA/OPLS-DA二維圖

    主成分分析(PCA)

    代謝組學生物資訊學分析

    靶向代謝組學

    非靶向性代謝組分析

    脂質代謝組學研究(Lipidomics)

    未知代謝物鑑定

    外源性代謝物分析服務

    代謝通量分析服務

提交需求
姓名 *
聯繫類型 *
聯繫方式 *
項目描述
諮詢項目 *

 

How to order?


/assets/images/icon/icon-rc2.png

客服諮詢

/assets/images/icon/icon-message.png

提交需求

https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-wx-2.png

https://file.biotech-pack.com/pro/bt-btpk/image/head/config/20240322-7693-企业微信销售二维码.jpg

聯繫銷售人員

/assets/images/icon/icon-tag-sale.png

促銷活動

/assets/images/icon/icon-return.png