求助:真菌測序ITS和18S有哪些區別?
ITS是真菌基因組中的一個高變區域,位於真核生物的核糖體基因組中的18S-5.8S-28S rRNA基因間區域。ITS序列通常包括ITS1和ITS2兩個子區域,它們之間由5.8S rRNA序列連線。
18S rRNA是真菌核糖體基因組中的一個保守區域,它在真核生物中廣泛存在,用於構建系統發育樹和物種鑑定。
二者的區別:
1.變異程度:
ITS序列相對於18S rRNA序列來說更為變異。由於ITS序列在物種間變異較大,因此在物種鑑定和分類中具有更高的解析度。而18S rRNA序列相對保守,適用於更廣泛的系統發育分析。
2.物種鑑定:
由於ITS序列的高變異性,它在物種鑑定中更常用。ITS序列可以提供更多的資訊,幫助區分不同的物種和亞種。而18S rRNA序列通常用於更宏觀的分類和系統發育分析。
3.應用範圍:
ITS序列在真菌領域的物種鑑定和分類中應用廣泛,特別是在菌株鑑定和環境樣品中的真菌多樣性研究中。而18S rRNA序列則更常用於跨物種的系統發育分析,包括真菌與其他生物界的比較。
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