化學蛋白質組學
化學蛋白質組學(Chemical Proteomics)作為蛋白質組學的一個重要分支,整合了合成化學、細胞生物學和質譜學多種方法,旨在設計小分子探針以瞭解藥物發現中的小分子作用模式和蛋白質功能,在天然產物的背景下,化學蛋白質組學可用於識別活細胞中小分子的蛋白質結合伴侶或靶標。化學蛋白質組學由兩個關鍵步驟組成:(1)探針設計和合成;(2)目標捕撈和蛋白質鑑定。目前已經開發了4種不同型別的探針以篩選具有不同結構的小分子靶標;打靶之後,也有多種蛋白質鑑定方法,適合不同的情況。化學蛋白質組學為靶點反捲積、藥物反應生物標誌物的發現以及用於臨床前靶點驗證的疾病途徑分析提供了一系列新穎的方法,在藥理學研究領域,已廣泛用於識別藥物靶點並研究其作用機制。
化學蛋白質組的應用
百泰派克生物科技(BTP)採用高分辨質譜平臺開發並驗證了尖端的化學蛋白質組學技術,可用於生物標誌物研究、藥物和靶點發現、通路建模、作用機制研究等眾多領域,旨在為客戶提供優質、全面的靶點解摺積服務。我們提供多種方法來識別和驗證新藥物靶點,以滿足不同的需求。
設計和合成探針是化學蛋白質組學方法中靶標識別的初始和關鍵步驟。BTP提供常用的四種探針,包括(1)固定化探針:將生物活性天然產物被共價固定在生物相容性惰性樹脂上(如瓊脂糖和磁珠),例如瓊脂糖和磁珠,作為篩選活性蛋白質組中目標蛋白的誘餌;(2)基於活性的探針(ABP):ABP考慮了藥物分子的活性,在富集前可以與活性蛋白質組中的蛋白質相互作用,甚至可以穿過細胞膜與活細胞中的靶蛋白結合,潛在地反映了細胞內生理條件下真實的藥物與靶點的相互作用;(3)點選化學探針:此類探針透過與其互補體(如疊氮化物、炔烴等)進行生物正交點選反應,從而將探針共價連線到親和標籤(生物素-疊氮化物、生物素-環丙烷等)或熒游標籤(羅丹明-疊氮化物、FITC-疊氮化物等)上,用於後續富集和目標鑑定;(4)光親和探針:光親和探針由點選化學探針骨架和用於固定探針與靶標之間結合的光親和基團組成,在特定波長光的照射下,光親和基團會產生高活性自由基促使活性分子與靶標共價結合。
Chen, X.; et al. Sig Transduct Target Ther. 2020.
不同型別化學蛋白質組學探針的一般分子結構
對於一些沒有適合修飾位點或修飾後影響活性的天然產物,BTP也提供基於藥物親和力響應靶點穩定性(DARTS)和熱分析蛋白質組分析(TPP)的非標記化學蛋白質組學方法。DARTS依賴於透過與小分子相互作用賦予靶蛋白的蛋白水解保護,首先用目標化合物和載體對照或無活性類似物簡單處理細胞裂解物的等分試樣,然後用蛋白酶有限消化細胞裂解物中的蛋白質,隨後透過 SDS-PAGE 分離樣品並染色,以鑑定免受小分子蛋白水解的蛋白質條帶最後使用 MS 來識別每個條帶中存在的蛋白質。
Chen, X.; et al. Sig Transduct Target Ther. 2020.
非標記化學蛋白質組學方法流程
百泰派克生物科技化學蛋白質組學全面解決方案包括從實驗設計、樣品製備、探針合成、靶標鑑定以及資料分析的全流程,為您提供一站式的無憂服務,滿足您在藥物開發和藥物發現領域生物標誌物研究、藥物和靶點發現、通路建模、藥物作用研究等的多種需求。藉助我們全面的解決方案,您不會在錯誤的候選藥物上浪費時間和成本,並且能夠最佳化藥物開發和藥物發現計劃的成功率。歡迎免費諮詢,瞭解更多服務詳情!
中/英文專案報告
在技術報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜引數(中英文)
3. 化學蛋白質組學詳細資訊
4. 質譜圖片
5. 原始資料
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